智破两仪副本的核心机制在于分阶段获取宝箱，尤其是隐藏箱子的获取逻辑。前八个宝箱可通过常规探索完成，需踩踏所有机关、清理全图怪物并走遍地图。这类操作对战力要求较低，关键在于耐心排查地图细节。后两个隐藏箱子需通过重置副本完成，涉及与山贼和村长的对话选择，属于剧情分支设计。战力不足时可通过提升BUFF或调整战斗策略弥补输出不足。
首次通关时，与村长对话后击杀左上角山贼，可获得倒数第二个红色命星宝箱。此后必须重置副本，再次与村长对话并选择相信山贼，返回击杀变身为山贼的村长，最后与左上角山贼交互即可获得最终宝箱。这一过程无需额外战力，但需注意对话顺序不可出错。重置副本会清空进度，建议先确保前八个宝箱已全部收集。
战斗策略上，低战力玩家应优先选择控制型神兵或具有持续伤害效果的武将，毒、灼烧类技能。此类效果可抵消输出不足的缺陷。副本中的小怪血量较低，但部分机关需要特定走位触发，建议提前规划路线以避免重复战斗消耗。若遇到瓶颈，可尝试更换武将站位或调整技能释放顺序。
最后两个隐藏箱子的剧情逻辑是相互冲突的设计。首次选择击杀山贼会关闭另一条分支，因此必须通过重置副本来解锁。这一机制与常规副本不同，但难度并未提升。完成全部十个宝箱后，副本奖励包含命星等关键资源，对战力成长有显著帮助。整个流程的核心是理解分支剧情而非单纯依赖数值碾压。
重置副本是必要操作，且无需额外资源消耗。该副本的设计更侧重解谜而非战斗难度，适合各类玩家逐步完成。
