击败肉山后游戏将永久进入困难模式，世界会生成神圣与腐化/猩红两种新生物群落并开始蔓延。需要使用肉山掉落的圣锤摧毁恶魔祭坛来生成新三矿（钴蓝/钯金、秘银/山铜、精金/钛金），这是后续挑战的基础准备。机械三王（毁灭者、双子魔眼、机械骷髅王）是首批推荐挑战的Boss，其召唤物可通过新矿物合成，其中毁灭者因攻击模式规律且掉落魂类材料，常被优先选择。
过渡期装备推荐优先制作精金/钛金套装，远程职业可使用代达罗斯风暴弓配合圣箭对抗毁灭者。战斗前需搭建多层平台并配备心形雕像、篝火等增益设施。击败任意机械Boss后神圣套装的闪避效果能显著提升生存能力，同时蒸汽朋克人入驻会提供喷气背包等关键机动装备。
第二阶段建议挑战世纪之花，需在丛林地下寻找粉色花苞。应配备乌龟套或蘑菇矿套，近战武器可选择真永夜之刃或死神镰刀。注意花苞被破坏后生成的世纪之花会随玩家位置移动，战斗区域需清除障碍物并预留纵向机动空间。击败后获得神庙钥匙并触发地牢变异事件。
石巨人作为丛林神庙的守关Boss，需用蜥蜴电池激活。推荐使用泰拉刃或猪鲨链球等穿透武器，注意其头部脱离后的第二阶段会增强攻击频率。胜利后拜月教徒将在地牢入口刷新，击败他们可触发月亮事件，最终迎接月球领主的终极挑战。
整个困难模式的Boss挑战需注意环境控制，神圣与腐化/猩红的蔓延需要用隔离带阻隔。每次击败Boss后NPC商店会更新高级物品，应及时补充药水和饰品。战斗策略需根据职业特性调整，如法师注重回蓝与爆发时机，射手侧重走位与弹药效率。
